Ενώ σήμερα η Θεσπρωτία συρρικνώνεται πληθυσμιακά, πριν την απελευθέρωση από τους Τούρκους ο αριθμός των κατοίκων της, σε χωριά και κωμοπόλεις ήταν μεγάλος.
Το 1452 η Παραμυθιά κυριεύεται από τον Σουλεϊμάν Μεχμέτ Πασά, ενώ η Σαγιάδα από τους Ενετούς πέφτει οριστικά στα χέρια των Τούρκων. Οι Ενετοί ονόμαζαν την Σαγιάδα Bastia και εκμεταλλεύoνταν τις αλυκές αλατιού που υπήρχαν στην περιοχή.
Σημαντικά σημεία για την διακίνηση των προϊόντων προς τα Γιάννενα ήταν η Σαγιάδα και το πέρασμα του Ελευθεροχωρίου, όπου ο Αλή Πασάς των Ιωαννίνων έχτισε το σωζόμενο και σήμερα κάστρο του.
Οι Τούρκοι αγάδες της Θεσπρωτίας ήταν φεουδάρχες και οι πύργοι τους (κουλιές) υπάρχουν και σήμερα στην Παραμυθιά, το Μαργαρίτι και στον πύργο Ραγίου.
Οι συνθήκες της ζωής των κατοίκων ήταν δύσκολες, καθώς ζούσαν κάτω από καθεστώς σκληρής δουλείας με πολλούς περιορισμούς, αλλά και μεγάλους φόρους, ενώ η περιουσία τους ήταν τσιφλίκια των Τούρκων.
Διεκδικώντας της γη τους οι κάτοικοι 16 χωριών της Μουργκάνας ξεσηκώθηκαν εναντίων των αγάδων.